Un típico sistema Amoeba consistirá de tres clases funcionales de máquinas.

Primero: cada usuario tiene su estación de trabajo para correr la interface de usuario, el sistema X windows. Esta estación de trabajo puede ser de ingeniería, o una terminal especializada X.

Segundo: existe un conjunto de procesadores que son dinámicamente asignados a usuarios, como son requeridos.

Estos procesadores pueden ser parte de un multiprocesador o multicomputador, ser una colección de computadores de una sola tarjeta o un grupo de estaciones de trabajo asignados para este propósito.

Tercero: hay servidores especializados como son servidores de archivo y de directorio que corren todo el tiempo. Ellos pueden correr en un procesador del conjunto de procesadores, o en hardware dedicado, o como se desee.